利用电子健康记录的深度学习方法识别RCC复发
发布日期:2024-12-15 05:53 点击次数:99深度学习算法精准识别RCC复发获突破。
尽管纵向电子健康记录( EHR)数据为开发 肾细胞癌(RCC)预后模型提供了宝贵的资源,但这些数据缺乏包括复发在内的明确编码的临床结局。在2024年 欧洲肿瘤内科学会(ESMO)公布的一项研究(摘要号1713p)
[1]
利用这些数据,旨在设计一种深度学习算法,能够准确识别局限性肾细胞癌患者中的复发信息。
研究方法
整理了在麻省总医院布里格姆(MassGeneralBrigham)中具有RCC诊断编码的28,715例患者的编码和叙述性电子健康记录数据,包括通过自然语言处理提取的癌症特征。通过人工病历审查,为350例患者标注了RCC诊断、复发时间和状态的金标准标签。研究使用了一种半监督标签高效的疾病事件表型深度学习算法(LATTE),以确定符合条件的肾切除术后非转移性RCC患者的复发状态和复发时间。将LATTE在电子健康记录数据中识别的RCC复发情况与金标准标签进行验证,并随后用于估计按AJCCTNM分期和Fuhrman分级分层的复发率。
研究结果
符合条件的研究队列包括5,992例患者。通过LATTE在电子健康记录数据中识别的RCC复发情况在针对标注复发情况的验证中,C统计量为0.928。估计的5年复发率为16.7%(表1)。研究发现T3期患者的复发风险显著高于T1期(3.4%)或T2期(14.3%)患者,达到了49.7%。
表1.RCC患者5年复发率
研究结论
本研究成功开发了一种深度学习算法,能够从庞大的电子健康记录数据中识别RCC的复发情况,从而极大地减少了耗时费力且资源密集型的病历审查需求。作为持续研究工作的一部分,通过LATTE在电子健康记录数据中识别的RCC复发情况将进一步用于开发精确的复发风险预测模型,以便识别出复发风险较高的局限性RCC患者。
本研究旨在探索利用EHR的深度学习方法,以精确识别RCC患者的癌症复发情况。RCC作为一种常见的泌尿系统恶性肿瘤,其复发监测对于患者的预后管理至关重要。然而,传统的复发识别方法,如病历审查和影像学检查,不仅耗时费力,而且可能受限于数据完整性和医生经验的差异。
为了解决这一问题,本研究团队开发了一种基于深度学习的算法,该算法能够从大量的电子健康记录中自动提取和分析与RCC复发相关的关键信息。研究团队首先对一批具有RCC诊断编码的患者的EHR数据进行了整理,包括患者的癌症特征、治疗历史以及后续的随访记录等。随后,利用半监督学习方法,结合少量的金标准标签数据(即经过人工验证的复发情况),对深度学习算法进行了训练和验证。
结果显示,该算法在识别RCC复发方面表现出了极高的准确性,C统计量达到了0.928,这意味着算法能够很好地区分复发患者和未复发患者。此外,研究团队还利用该算法对一批符合条件的RCC患者进行了复发风险评估,并发现不同TNM分期和Fuhrman分级的患者具有显著的复发率差异,这进一步验证了算法的有效性和实用性。
本研究的成功不仅为RCC复发的自动识别提供了一种新的技术手段,也为其他类型癌症的复发监测提供了新的思路。未来,研究团队将继续优化算法性能,提高其在不同临床场景下的适用性和准确性。同时,他们还将探索将该方法应用于更广泛的癌症类型,以及与其他生物标志物和基因组数据相结合,以构建更加全面和精准的癌症复发预测模型。
参考文献:
[1].Jue Hou,et al.A deep learning approach utilizing the electronic health record (EHR) to identify cancer recurrence in renal cell carcinoma (RCC)
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